El número de febrero de 2016 de la revista Dengeki Maoh de Kadokawa ha publicado el capítulo final del manga Zettai Zetsubou Shojo: Danganronpa AE – Genocider Mode de Kaoru Minamimachi. El segundo tomo recopilatorio de la obra se lanzará el 27 de enero a la venta.

El manga adapta la historia del juego para PSVita Danganronpa Another Episode: Ultra Despair Girls desde la perspectiva de Toko Fukawa. Minamimachi comenzaba con la obra en enero de 2015.